Sky Alchemy’de gözlerini gökyüzünde süzülen küçük bir adada açıyorsun. Elinde sadece bir sandık, birkaç temel alet, bir meşe tohumu ve “The Island of Trials” adlı gizemli bir görev kitabı var. Kitaptaki ilk gerçek cümle: “Adada hayatta kal.”
Onlarca görevi tamamlayarak kendi yolunu seçiyor, The Ultimate Engineer ya da The Arcane Mage olmaya doğru ilerliyorsun. Envanterindeki görev kitabı her adımı yönlendiriyor; Sky Alchemy’nin sonunu ise tamamen sen yazıyorsun.